Atualmente o PPGCOM conta com as seguintes Comissões permanentes (compostas por docentes e discentes):
(1) Comissão de Acolhimento e Acompanhamento Discente;
(2) Comissão Sucupira;
(3) Comissão de Comunicação e Divulgação Científica;
(4) Comissão de Egressos;
(5) Comissão de Pesquisa e Eventos;
(6) Comissão de Bolsas;
(7) Comissão de Internacionalização e Parcerias;
(8) Comissão de Atividades Complementares;
(9) Comissão Proap.